起きている間にしているのであれば、「くせ」である可能性が高いのではないか、と思います。特にやめさせなくてもよいかと思います。
　不安であるならば、赤ちゃんの普段の様子をビデオに撮って、それをかかりつけの小児科専門医に見てもらってはいかがでしょう？